根據(jù)鏡體的構造，可見光顯微鏡可以分為：
        倒置顯微鏡：這是一種把照明系統(tǒng)置于載物臺上面，把物鏡置于載物臺下面的顯微鏡。這種顯微鏡由于大大加長了載物臺上放置樣品的高度，可以放置培養(yǎng)器皿。因此多用于觀察培養(yǎng)的活體細胞和組織。
        實體顯微鏡：這是一種利用斜射光照明觀察物體的外部形態(tài)和立體結構的顯微鏡。這種顯微鏡放大倍數(shù)較低，一般為60-500×。但是它的應用范圍非常廣泛，可以用于工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)及科學文化事業(yè)的許多領域。
        比較顯微鏡：這實際上是一種合并在一個鏡架上的兩臺顯微鏡，但是它可以把兩個標本的像借助于棱鏡組合在一個目鏡的兩半視野內，用于比較兩個標本的結構和染色。
        根據(jù)像的形成技術可以分為：
        相差顯微鏡：這種顯微鏡具有特殊的相差集光器和相差物鏡。
        干涉相差顯微鏡：這種顯微鏡使通過標本的光線和通過標本之外的光線發(fā)生干涉并把光的相位變化變?yōu)檎穹�變化，從而可以觀察染色或未染色物體的細微結構并能測定標本中干物質的含量。
        偏光顯微鏡：這是一種利用偏振光原理來觀察具有雙折射特性物質的顯微鏡。